เบทาอีน สามารถใช้เป็นสารเติมแต่งอาหารเพื่อปรับปรุงสุขภาพลำไส้ ปัจจัยที่ไม่พึงประสงค์ เช่น ความเครียดจากความร้อนอาจทำให้ลำไส้มีความยืดหยุ่นไม่ดีในสัตว์ เมื่ออุณหภูมิแวดล้อมสูงขึ้น เลือดจะไหลเวียนไปที่ผิวหนังเป็นพิเศษเพื่ออำนวยความสะดวกในการกระจายความร้อน ส่งผลให้การไหลเวียนของเลือดไปยังทางเดินอาหารลดลง ซึ่งจะส่งผลต่อการย่อยอาหารและลดการย่อยได้ของสารอาหาร

ความเครียดอาจทำให้เกิดการเปลี่ยนแปลงในโครงสร้างลำไส้ของสุกรที่กำลังเติบโต หากไม่มีการควบคุมเพิ่มเติม การทำงานของลำไส้จะลดน้อยลง เบทาอีนมีประโยชน์ต่อโครงสร้างลำไส้และระบบภูมิคุ้มกันของสัตว์ มีประโยชน์ในการรักษาความสมบูรณ์ของลำไส้ของสัตว์ มันสามารถปกป้องสัตว์จากการขาดน้ำที่เกิดจากโรคบิดหรือการแพร่กระจายของจุลินทรีย์ที่ไม่พึงประสงค์อื่น ๆ ในลำไส้

การวิจัยแสดงให้เห็นว่าการใช้ยาเบทาอีนและไอโอโนฟอร์ผสมกันสามารถลดความเสี่ยงของการติดเชื้อค็อกซิเดียในสัตว์ได้อย่างมาก และปรับปรุงฟังก์ชันการเจริญเติบโตและการดื้อยา โดยเฉพาะอย่างยิ่งสำหรับลูกสุกร การเพิ่มเบทาอีนในอาหารของพวกมันสามารถปรับปรุงทั้งการทำงานของลำไส้และป้องกันโรคท้องร่วง และเพิ่มปริมาณอาหารซึ่งมีคุณค่าทางปฏิบัติที่โดดเด่น นอกจากนี้ การเพิ่มเบทาอีนในอาหารสัตว์สามารถบรรเทาการตอบสนองต่อความเครียดของลูกสุกร จากนั้นจึงปรับปรุงการบริโภคอาหารและอัตราการเติบโตของลูกสุกรหย่านม